vmd rmsd
VMD中如何计算两个分子的RMSD值?
导入成同一个分子的两帧，Extensions→Analysis→RMSD Trajectory Tool，选区选要计算RMSD的组，关掉noh(...
分析力学如何证明晶格振动是独立谐振子?
11.1 RMSD分析 11.2 B-Factory 分析 11.3 RMSF分析 AM16:00~17:0011.4 RG分析 11.5 VMD动画...
计算机辅助药物设计是如何实现从虚拟筛选到新药临床的...
12, 71347145.(a) RMSD和2D_RMSD检验模拟的稳定性(b) 结合自由能的对比与分析(c) 热力学积分...
轨迹文件mdcrd过大,VMD总是出错,有什么解决办法
zh1987hs(站内联系TA)AMBER本身不知道有没有可将轨迹分段的小程序，比如NAMD的catdcdfantastic(站内联系TA)你可以使用ptraj计算RMS...
namd是什么意思
RMSD值是非常常用的一项参数,用于衡量原子偏离比对位置的程度。
如何上手GROMACS进行分子动力学模拟?
01 分子动力学 分子动力学是利用牛顿经典力学来模拟分子体系的运动的方法。在由分子体系不同状态构成的系...
有什么软件可以做多肽二三级结构预测?
（2）当match的主链RMSD大于1.5埃时，可能代表了受体主链构象变化后的结合模式。为了说明优势，作者在...
什么服务器比较适合分子动力学模拟?
VMD检查体系中蛋白质和离子分布 06 体系能量最小化 命令如下，本命令同样需要mdp参数文件，名为minim....
gromacs跑完后不知如何分析?
10.计算RMSD gmx_mpi rms -f MD.xtc -s MD.tpr -o allbackbone.xvg 11.能量计算（根据提示，...
你参与过/用过/看过的与计算化学相关的 Python 项目...
有人可能发愁Python多慢啊，但算积分的function是用 c写的，外带Intel优化过的blas，感觉自己萌萌哒。啊...