PYMOL
做分子对接用pymol可视化时,小分子化合物和蛋白质之间...
在PyMOL中进行分子对接并可视化时，如果小分子化合物和蛋白质之间没有显示氢键，可能是由以下几个原因造成的：1.氢键参数设置不当：在 PyMOL 中...
pymol蛋白和小分子离很远怎么办 - 编程语言 - CSDN问答
可以使用Pymol命令来修改坐标,例如使用alter命令修改原子坐标,或者使用translate命令平移整个分子。 检查蛋白和小分子的选择:确保在加载蛋白和小分子...
Pymol怎么用?
不知不觉距离PyMOL安装教程的坑已经挖了快一年了，在“坑面硬化”之前让我赶紧续上PyMOL的基础操作方法。没有安装PyMOL的同学可以按照“PyMOL...
pymol中查看配体时出现问题,Autodock输出文件的坐标...
检查Autodock的输出:回到Autodock的输出结果,确保对接过程没有出错,配体确实被正确地放置在了受体的结合位点。如果对接过程中出现问题,那么在PyMOL中...
Pymol自动化显示小分子 - 蛋白相互作用
编写一个Pymol脚本，该脚本利用Pymol自带的distance命令来判断小分子与蛋白质之间的相互作用，包括氢键、盐桥、PiPi、CationPi等。运行脚本：在终端中运行命令pymol qc show...
Pymol处理对接结果作图
Pymol处理对接结果作图的方法如下：文件准备：导出小分子和蛋白的PDB文件，文件命名建议为“小分子_蛋白.pdb”与“蛋白原配体.pdb”。力分析：上传对接文件至PLIP网站进行力...
pymol怎么下载?
pymol怎么下载？安装（教育版）1、下载pymol，点击Windows EXE installer，下载好后安装 官网地址：PyMOL|http://pymol.org 进入pymol官网 2...
用pymol可视化蛋白质3D结构,为什么二级结构出现碎片化...
书接上文，在安装和了解PyMOL基础操作的基础上，我们就可以进一步做蛋白质结构的可视化了。前期PyMOL的安装和基础操作的教程在链接如下，需要的...
pymol;金属离子结合位点绘制 - 编程语言 - CSDN问答
添加金属原子 :如果您已经知道金属离子的坐标,可以使用PyMOL的命令来添加金属原子。假设金属离子的坐标为(x, y, z),元素为M,可以使用以下命令...
pymol有什么用
Pymol是一个在结构生物学研究和可视化工作中非常重要的工具，主要具有以下用途：强大的结构显示和分析功能：Pymol能够制作出炫酷且具有视觉冲击力的结构模型，是展示和分析...