Pymol怎么用?

操作使用PyMOL主要可以通过鼠标、菜单栏、输入命令或运行脚本来实现。其中,大部分的操作是可以通过点击鼠标下拉菜单来实现。也可以使用键盘通过在命令栏(1或2皆可)输入指令实现。还可以将命令组合成脚本,通过运行脚本来实现相关功能。1)菜单栏:右侧菜单栏中从左至右依次为:输入文件的名称,通常默认为输入的PDB文件名。A(A


做分子对接用pymol可视化时,小分子化合物和蛋白质之间...

在PyMOL中可视化分子对接时,如果没有看到小分子化合物和蛋白质之间的氢键,可能有以下几个原因:距离和角度参数不合适:PyMOL使用特定的距离和...


科学可视化软件介绍 – PyMOL

PyMOL是一个开源但同时又是专有的分子可视化软件,由Warren Lyford DeLano博士于2000年左右开发。在2003年,DeLano博士创立了DeLano Scientific LLC公司,专注于PyMOL的继续...


Pymol 软件介绍

PyMOL是一个功能强大的分子可视化软件,由Warren Lyford DeLano开发,广泛应用于生物医学、化学和材料科学等领域。其主要特点包括强大的三维可视化功能、灵活的操作方式、内置的...


如何在Linux系统中安装PyMOL开源版? - 编程语言 - CSDN问答

graph TD A[开始安装PyMOL] --> B{选择安装方式} B -->|pip安装| C[安装必要依赖] B -->|conda安装| D[安装Miniconda] B -->|...


用pymol可视化蛋白质3D结构,为什么二级结构出现碎片化...

书接上文,在安装和了解PyMOL基础操作的基础上,我们就可以进一步做蛋白质结构的可视化了。前期PyMOL的安装和基础操作的教程在链接如下,需要的...


Pymol可以把两个蛋白结构进行对比么?

本期文章将为大家介绍PyMOL插件interfaceResidue,这是一款能够高效识别和分析蛋白质复合物接触界面残基的工具,尤其是在大规模复合物结构分析中,...


PyMOL:您真正需要知道的 10 个非常基本的命令【01】 - 百度知...

(选择bg_color white的结果)(选择bg_color cyan的结果)命令 2 - 去除PyMOL中的溶剂 在蛋白质结构分析中,溶剂分子(如水分子)通常用于提供稳定...


Pymol激活常见技术问题:如何正确激活Pymol并解决许可...

确保正确安装PyMOL并配置许可文件路径(如 `.pymolrc` 或 `pymol.lic`),必要时手动设置 `PYMOL_PATH` 和 `PYMOL_LICENSE` 环境变量。


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