contign50

这一条contig和scaffold的长度就叫做Contig N50和Scaffold N50。这两个数值主要用来评估序列组装的质量的，值越大，组装效果越好，测序效率也就越好了。Contig...

累加顺序：Contig 1（2 Mb）+ Contig 2（1.5 Mb）+ Contig 3（1 Mb）+ Contig 4（0.6 Mb）= 5.1 Mb（≥5 Mb）。Contig N50 = 0.6 Mb（Contig 4的长度...

这使得我们能够进行contig级别的组装和完善（表1，附表2，图1），得到了三个contig N50值分别为22.3、37.6和6.8 Mb的草稿基因组（附表3）...

根据Hi-C数据，超过98%的contig序列被锚定在两种单倍型的染色体水平的基因组上，单倍型1的总基因组大小为358 Mb (Hap1:contig N50: 26.02Mb...

使用idseq组装contig写说明并标注鉴定_20211206

l50更注重条目的数量统计，而n50则侧重于片段长度的考量。具体来说，l50是指能够覆盖基因组50%长度的最小连续序列（contig）的数量。这意味着，如果一个基因组的l50值为...

例如，对于牦牛，其推荐的参考基因组的contig N50仅为22.8 kb，但存在其他三个连续性更高的牦牛基因组，其中一个的contig N50高达72.3 Mb。

这张图评估了contig N50、auN和GCI得分在量化组装连续性方面的敏感性。使用公开发布的基因组和模拟数据评估了这些指标的敏感性。为了使它们可比，...