ensembl
基因组下载新方法:Ensembl - 百度经验
1 通过百度搜索,进入Ensembl主页 2 点击Download,进入下面界面 3 点击页面右侧的 “Download data via FTP”,进入下载界面:4 点击红框中的FTP site...
基因启动子区域预测的网站有哪些?
1.用NCBI:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2.用UCSC:http://www.genome.ucsc.edu/ 3.用Ensembl:http://www.ensembl.org/index.html 4.用公司信息(只包含公司...
【技术贴】如何从数据库挖掘基因并筛选TagSNP(医学篇)(2...
2.利用ensembl在线工具获得Haploview4.2软件输入格式文件 Haploview4.2软件导入基因型文件格式为ped文件,因此根据基因物理位置利用ensembl在线工具Vcf to Ped转换工具获取汉族人...
解析Ensembl 的数据库服务器(图文详解)
Ensembl 依赖 MySQL 和 MariaDB 这两大数据库管理系统,它们的起源和关系略有渊源:MySQL 由麦克尔·维德纽斯开发,后被 Oracle 收购,社区成员为避免版权风险,创立了 Mar...
关于人参考基因组的一些总结
用很长的N间隔这些ALT contig序列增加了不必要的ref的size Ensembl 可以下到最新版 ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-98/fasta/homo_sapiens/dna/ ftp://ftp.ensemb...
常用或特别的人类fasta参考基因组下载链接
获取常用或特别的人类Fasta参考基因组,可以通过FTP链接从大型国际基因组网站下载。常见的版本有:NCBI36 / hg18human_b36 (女/男版本)Ensembl release 54Homo_sapiens....
【必备技能】基因注释方法合集
如ENSG00000141510,Ensembl数据库的详尽注释让每个基因可能有多个ID,其中ENSG是标志;G、T、P分别代表Gene、Transcript和Protein,例如ENST是转录本ID,而NP代表蛋白质ID。在...
Ensembl数据库
Ensembl的覆盖范围广泛,囊括了诸如人类(Human)、小鼠(Mouse)和斑马鱼(Zebrafish)等模式生物,为科学家们提供了丰富的研究资源。以人类为例:Ensembl的深度洞察当我们在Ensembl...
想了解有鱼类(比如斑马鱼)疾病靶点数据库吗?
它还注释基因、计算多重比对、预测调节功能并收集疾病数据。Ensembl 工具包括 BLAST、BLAT、BioMart 和所有支持物种的变异效应预测器 (VEP)。网址...
生物信息学网站有哪些
2. ENSEMBL ENSEMBL提供全面的基因组数据,包括基因注释、蛋白质序列和基因组结构变异等信息。其网站还提供了强大的可视化工具,方便研究者进行基因定位和数据分析。3. EBI...