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GWAS单倍型分析和PRS分析?
PLINK/SEQ：功能：测序数据支持：作为 PLINK 的扩展版本，PLINK/SEQ 增加了对测序数据的支持，能够处理外显子组测序和全基因组测序等数据。遗传分析功能：继承了 PLINK 的一些功能，如关联分析、单倍型分析等，同时针对测序数据进行了优化和扩展。特点：数据格式兼容性：能够处理多种常见的测序数据格式，方便用
怎么分析一个细菌的基因组数据?
鉴于Haplosaurus主要针对药物设计的特定基因检查，它不适合生成蛋白质组范围的序列数据库。同样，PrecisionProDB从个体相位基因型创建蛋白质单倍型数据...DNTR-Seq重叠分析提供与覆盖无关的倍性或细胞数测定直接标记后，特定基因组位点（其物理基因组覆盖范围）的重叠片段数量受到该位点倍性的限制。
解读“浅层测序“ - “浅测序“ - “低深度测序“
首先是上游处理,将FASTQ文件经过比对去重等步骤处理为BAM文件;接下来通过自研算法生成潜在变异列表,这一步利用了DNAscope的优异Haplotye拼接以及超高灵敏度,确保尽可能少的假阴性;最后在...
基因分型如何进行分析?
1）基因型数据（必须）既然单倍型分析需要变异位点信息，自然就需要基因型数据。基因型数据可以有很多来源，首先，可以零成本从各大公开数据库下载（...G. & Diao, X. geneHapR: an R package for gene haplotypic statistics and visualization. BMC Bioinformatics 24, ...
2023 年,生物学领域发生了哪些大事件?
此外，经RNA测序(RNA-seq)检测，在所有转化的ESC中，多个原始ESC富集基因下调，而在4CL和5iLAF ESC中，原始多能性网络被更强地激活。基因本...
基因组测序获得了HiFi、Hi - C和DNB数据,后续应该如何...
通过CENH3 ChIP-seq和聚类分析，研究发现Ga着丝粒中仅5个重复序列高度富集，而Gr的10个重复序列中有4个与TM-1的6个重复序列同源，表明多倍化...
如何通过snp位点找到候选基因?
a one-factor model, a one-factor residuals model, a two-factor model, and a latent growth model.Haplo2PedDescription:HaploPainterDescription...such as RAD-seq.STRait Razor v2sDescription: A tool for short tandem repeat (STR) analysis. It also contains a database of about 2...
基因共表达模块分析到底是做什么的?
基因共表达是一种使用大量基因表达数据构建基因间的相关性，从而挖掘基因功能的一类分析方法。通过基因共表达网络分析方法，可以将在功能上相关的...
组装了一个没有gap的T2T基因组,但又说没有鉴定到某条...
其他可用于辅助组装的数据类型包括Pore-C（ONT+Hi-C）、Strand-seq，以及现代短读长技术，如stLFR、TELL-seq和haplotagging（它们产生来自基因组...
全球首例经脐带血移植治愈HIV患者出现,造血干细胞移植...
”大家都在看参考资料 [1] Yvonne Bryson, HIV-1 Remission and Possible Cure in a Woman after Haplo-Cord Blood Transplant, Cell (...