n50 测序
基因组测序中N50分析指的是什么? – 手机爱问
N50值是评定基因组拼接好坏的一个标准,一般来说是越大越好,说明你得到的contig越长。 相关回答 遇*** 2014-01-05 为什么要进行基因组测序? 基因组测序已经成为生物学领域最炙手...
真菌基因组测序,连续片段的contign50长度多大比较合适? - 百度...
N50的长度是一个相对数值，可以简单的理解为拼接的中间值，当然是在基因组范围内越长越好。不过目前的测序公司给出的contig N50≥20K是一个保底值，真菌样品要求单倍体，...
基因组装的时候参数N50的大小反映什么问题?是不是n50越...
N50是gene sequencing的一个最常用的指标。它是将contigs长度由大到小排列，当长度累加到所测基因总长的50%时那个contigs的长度，以此类推，也有N60，N70，N80等等。不过...
高通量测序中,基因组装的指标N50的意思例如:某次组装...
比如这个基因组的大小是1000bp,那么装出来的scaffold,比如是,227bp,273bp,500bp 这样的三个scaffold,恰好273+227=500bp为基因组大小的一半,则N50 length = 273.
三代测序技术助力真菌基因组测序 - 百度经验
Contig数为82325个，N50仅为1666bp，而且其中32.4%都是长度仅300-900的短Contig，于是他们加测了10X覆盖度的PacBio数据，最终使QV值达到59....
复杂基因组测序经典案例 - 百度经验
在该研究中，天津生物芯片与研究人员尝试使用了从一代到三代的各种测序平台以及各种组装软件，最终完成了凡纳滨对虾的全基因组denovo测序和组装，获得的参考图谱ScaffoldN50达到606Kb。3...
在序列拼接中,为什么说n50越大,拼接效果越好
因为如果n50越大，表明那些含有较多碱基的reads就较多，也就是长片段的reads很多，当然拼接的效果也就越好。举个例子，比如一个基因组大小是1M...
用于较大基因组三代测序拼接的软件或者策略有哪些...
以前短read测序时代(大约在2015年之前发表的基因组)，基因组组装是一个老大难的问题，contig N50也就是几十kb样子。自从三代测序商业化一样，...
对细菌基因组来说Scaffold N50有什么意义
首先要明白N50的概念，将所有scaffold逐个相加，达到总长度一半时的scaffold长度就叫N50，它相对表示了一个中段位scaffold的长度，这个长度越长自然就表示scaffold整体长度都越长...
高通量测序基因组拼接技术指标中的Contig N50和...
这一条contig和scaffold的长度就叫做Contig N50和Scaffold N50。这两个数值主要用来评估序列组装的质量的，值越大，组装效果越好，测序效率也就越好了。