pfam
pfam域是什么
数据库Pfam数据库是一系列蛋白质家族的集合,其中每一个蛋白家族都以多序列比对和隐马尔科夫模型的形式来表示。pfam数据库是一个蛋白质家族大集合,依赖于由多序列比对和隐...
怎么截断蛋白结构域?
1、查找蛋白质的结构域可以通过Pfam、InterPro、SMART等数据库进行。2、截断结构域可以通过PCR定点突变或基因合成等方法来进行。3、新质粒的构建...
如何使用pfam查找基因家族的保守结构域?
方法一:网页工具 输入fasta格式就可以注释结构域了。 方法二:本地化的方法 首先下载pfamA数据库 然后用pfam_scan转件就可以了 PS:这个转件自己安装依赖太多,可能比较麻烦,用conda安装非常...
重新上线 | 基因家族序列 Pfam 扫描与可视化
重新上线的可视化功能,通过InterPro网站进行Pfam搜索,步骤如下:打开网页并点击「Search」,选择「By Sequence」,上传本地文件,一般一次不超过100个蛋白序列,超过时可先...
特发性室性心动过速吃什么药
3.儿茶酚胺敏感性IVT 采用β阻滞药效果最好。 (二)愈后室性心动过速患儿总愈后良好,Pfammatfer报道94例未有死亡病率,并认为婴儿期首次发作者,室性心动过速自行消失率明显高于幼儿期...
pfam:蛋白结构域预测
网址:Pfam现由InterPro托管 InterPro:InterPro Pfam数据库汇聚了众多蛋白质家族,每个家族都由多个序列比对和隐马尔可夫模型(HMMs)构成,用户可通过hmmsearch软件进行比对...
蛋白质是如何分家族的?如何查找蛋白质家族分类数据...
1.pfam:pfam是一个广泛使用的蛋白质家族分类数据库。它基于hmm(隐马尔可夫模型)建立,收集了整个生物界中的蛋白质序列,并将它们归类为不同...
请教Pfam数据库的搜索结果
Pfam-B是从ProDom数据库自动产生的,Pfam-B的数据质量、注释的完全程度都不如Pfam-A,但是Pfam-B可以作为一个有用的补充 。如果我的回答没能帮助您,请继续追问。你的...
全身长包块腺泡状横纹肌肉瘤2009。09月中旬... - 百度...
本病是1839年Stafford最早描述的Weber1854年首次应用横纹肉瘤这一名称Pfamneustia1892年把肉眼呈葡萄状的...
pfam结构域分析怎么解释
通常我们认为,结构域决定了这个基因的功能。随着高通量测序技术的发展,我们完全可以通过一级序列来预测该基因的结构域,pfam和smart数据库是一个不错的选择,