tcga数据库 教程
TCGA/TCIA数据库如何使用?
进入官网主页，此时可以点击Cohort Builder进行数据库筛选 以直肠腺癌为例，先在Program中选择TCGA数据库，再在project中选择TCGA-READ。TCGA中33种...
如何快速掌握TCGA数据库?
下载的数据为最新数据，和GDC TCGA官网保持一致 getsnvmaf 只需要提供正确的TCGA project名字即可；自动下载并整理TCGA MAF文件(masked somatic mu...
tcga数据库的使用教程 - 百度经验
2 进入Project页面点击自己需要的ProjectID，也可以点击右上角的FILES，选择进入Project页面。3 选择数据从自己所需数据类型的Files属性点进去，也可以通过左侧...
tcga数据库甲基化数据下载分析?
进入TCGA数据库官网，portal.gdc.cancer.gov，输入胆管癌的名称，点击PR, TCGA-CHOL，查看DNA甲基化数据。甲基化数据多由illumina的450K甲基化芯片检测得来。在跳转页面中，...
如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据(somatic mutation...
为了获取TCGA数据库中的体细胞突变数据，我们首先需访问TCGA网站并输入所关注的肿瘤类型。接着，点击WXS后面的“51”选项。导航至左上角的“File”菜单。从列表中选择“WXS...
如何从TCGA数据库下载DNA甲基化数据
首先，访问TCGA数据库官网portal.gdc.cancer.gov。在搜索框输入“胆管癌”（TCGA-CHOL），点击“PR”找到数据。接着，点击“Methylation Array”后的“36（Cases数）”。
全网最全!TCGA新版数据下载与整理教程来了!来抄作业! - 百 ...
TCGA数据库在四月份更新后，转录组层面的数据有了显著变化，包括数据的打包整合、使用最新的注释、以及区分编码与非编码RNA。TCGAbiolinks包是一个推荐的下载工具，操作简便，...
TCGA新版数据下载与整理教程来了!来抄作业!
1. TCGA转录组数据打包，一次下载即可获取counts、TPM、FPKM三种类型的数据，无需单独下载。2. 数据采用最新注释，Gene symbol已标注，无需额外注释。3. 转录组数据自带RNA...
TCGA GDC又双改版 新版本如何下载转录组数据?
TCGA再次改版，我整理了最新数据下载教程。下面以TCGA-BLCA膀胱癌count/TPM数据为例进行演示。步骤1：进入网站 使用谷歌浏览器打开新版TCGA网站，进入首页。步骤2：清空购物车...
如何快速掌握tcga数据库?
首先，可以尝试使用用户友好的数据探索工具如TCGA Data Portal。这是一个基于web的平台，用户无需编写代码，只需通过简单的界面操作即可获取所需的基因表达、临床数据等信息...