同一个分子对接结果，不同系统上PyMol软件显示氢键结果不一致？
粗粒化模型进行虚拟筛选的问题 - 服务器 - CSDN问答
手动构建配体:如果您的目标是对接一个小分子配体,那么可以直接在Chimera或其他分子建模软件中手动构建它,然后保存为pdbqt格式,这是AutoDock Vina所接受的格式。 尝试使用支持粗粒化模型的...
做分子对接用pymol可视化时,小分子化合物和蛋白质之间...
5. 软件限制：PyMOL 或使用的对接软件可能存在一些限制或bug，导致氢键没有正确显示。6. 计算资源限制：在某些情况下，如果计算资源有限，软件...
用Sailvina进行分子对接,Pymol可视化的氨基酸结合点与...
AutoDock对接后的结果是.pdbqt文件，如果在Pymol中可视化，我们需要先把pdbqt文件转化成pdb文件，我习惯使用OpenBabel，然后再进行可视化结果。一、...
计算机模拟分子对接的结果如何处理?
如果对接目标为已知活性位点的受体分子，此时只需通过ViewerPro Trial、Discovery Studio、pymol等软件在受体活性位点中确定一个中心坐标即可。以...
分子对接如何做啊?
（1）从结果看，配体和受体第一次结合的结合能为-3.02kcal/mol，和受体对接位点处形成2个氢键，一个是210位的TYR，另一个是214位的ILE，...
用pymol来处理分子对接后的结果,蛋白显示为surface,小...
请问您会了吗
有网络药理学的大神吗!?
常见的误区是认为只要没有氢键连接的分子对接结果不好，其实这种看法也是欠妥当的。即便没有氢键连接，只要结合能够低，也是作为小分子与靶蛋白质...
本人药理学研一学生,导师给的课题涉及到虚拟筛选,不是...
是对于大多数分子对接软件的打分而言比较困难的事情。那么，在目视筛查阶段，我们应该怎么估计分子间形成的氢键网络的好坏呢？a.口袋深处的密集氢键...
计算中量子化学计算和分子动力学模拟有哪些区别?
知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,...