hiseq2500测序

独占鳌头的Illumina仪器(二代测序篇)

Flowcell是Illumina测序仪的核心部件之一，它承载着测序反应的所有过程。以HiSeq2000为例，每个flowcell有8个泳道（Lane），每个泳道上又有两列，每列包...

lane是什么意思啊(illumina测序技术术语lane和run是什么意 ...

lane：在Illumina测序技术中，lane指的是flowcell上的一个通道。每个通道可以单独测不同的样品，互不干扰。例如，Hiseq2500测序仪的一张flowcell通常有8条通道，即8个lane...

如何从GEO数据库下载RNA - seq原始数据? - 编程语言 - CSDN...

在SRA页面可查看所有样本的SRR编号列表及其测序平台信息(如Illumina HiSeq 2500)3. 使用SRA Toolkit下载原始FASTQ文件SRA Toolkit 是NCBI提供的命令行...生信小博士的博客 geo读取表达矩阵 RNA-seq R语言方法一:1.从geo页面直接下载表达矩阵,然后通过r读取表达矩阵 2.利用getgeo函数读取表达矩阵 ...

illumina测序技术术语 lane和run是什么意思

Illumina的测序仪是以flowcell进行测序的，一般的一张flowcell是一个run，像Hiseq2500的话是2张flowcell，也就是一次运行的测序量。每张flowcell上通常都有多个通道，每个...

第二代高通量测序都有哪些平台

Illumina公司的Solexa测序平台，目前主流的型号的HiSeq-2500，以及Hiseq-2000，数据通量在每张Flow cell 300G数据，每次最多可以上2张Flow cell，单张Flow cell运行时间大约...

ENA数据库提交时如何正确格式化FASTQ元数据? - 编程语言...

例如，用户在XML或TSV元数据文件中将测序平台标注为Illumina HiSeq 2500，但声明的读长为300 bp，而该平台在指定模式下实际最大读长通常为150 ...

深度测序技术与生物信息学学习笔记(一)

Illumina测序系统：是目前应用最广泛的测序平台之一，包括HiSeq X Ten、HiSeq X Five、HiSeq 4000、HiSeq 3000、HiSeq 2500、MiSeq系列以及...

基因组测序在细菌基因组中的应用(二)

主要结果：使用Illumina HiSeq 2500 进行基因组测序。为了评估这些代谢突变是否产生耐药性，根据其患病率和临床意义，选择了与代谢相关的基因（sucA，gltD，ushA，icd，...

测序原理:一代二代三代测序原理详解

Hiseq2000测序仪测序仪搭配了两个flowcell，简称双流动槽。比较经典的Hiseq2500一次能产出700-800Gb数据（此处Gb为测序碱基数，不同于字节数的Gb）数据量=单端...

DNA甲基化

2000 V3 PE100的Lane，大概可以得到20G 左右的甲基化文库数据。也就是说，在HiSeq 2000或者2500平台上，甲基化文库的测序数据产量，一直都不是很高。质量也比较低。