如何使用pfam查找基因家族的保守结构域?

方法一:网页工具 https://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/pfamscanwww.ebi.ac.uk/Tools/pfa/pfamsca...


蛋白质是如何分家族的?如何查找蛋白质家族分类数据...

Pfam:Pfam是一个广泛使用的蛋白质家族数据库,它基于蛋白质域的序列和结构相似性进行分类。Pfam数据库包...


如何oku?

因此,使用Pfam数据库中一致的基因进行同源搜索(其实,你也可以使用已知作物中的基因进行同源搜索,获得...


如何利用生物信息学来做基因家族的分析与鉴定?

因此我们直接去Pfam数据库通过ID号检索下载hmm文件即可。


生信小白想入门生信,有没有比较系统的学习攻略?

3、pfam文件下载,以PF03106(WRKY)为例 点generate得到PF03106_seed.txt的pfam文件 可以进一步利用hmmer...


生信分析小白怎么入门?

再有就是我们要做结构域预测,文献中这两个网站(Pfam:http://pfam.xfam.org/和CDD:https://www....


如何克隆一个植物株高功能基因,并深入研究它的分子...

然后,我们收集了这些关键组分的Pfam域信息和蛋白质序列,通过Pfam数据库(版本34.0)和Blast(版本2.10...


能够免费下载到原核生物全基因组序列的核酸序列数据库...

筛选要下载的物种,下载列表,里面有Genebank和Refseq的FTP链接,然后使用wget循环下载就行了。JGI IMG数...


网上的生物信息学资源都有哪些?

EBI - 用的比较多的就只是Pfam(蛋白质家族)。其他不熟悉,就不细说了。 2.Genome Browser - 收集各类基因组范围数据的地方 UCSC - 老资格...


怎么进行酵母蔗糖酶的序列特征分析?

结构域:使用域预测工具(例如SMART、Pfam)鉴定序列中存在的结构域,如结构域、功能域或结构模体。保守...


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