rmsd计算
RMSD VS RMSF
RMSD关注的是单个时间点上结构相对于参考构象的偏差，计算方法是取每个原子位置与参考位置的偏移量平方和，再除以原子数并开方。例如，对于1ns的轨迹，每2fs保存一帧，50...
NAMD分子动力学入门——计算整个蛋白的RMSD值
在分子动力学的世界里，RMSD值是结构分析中不可或缺的度量工具，它揭示了原子在时间序列中的偏差程度。在NAMD的宏大舞台上，理解并计算整个蛋白的RMSD值，是深入探究蛋白质...
分子动力学模拟的研究热点?
用户可编写包含一系列命令的脚本，对 MD 模拟数据进行复杂分析。例如，计算蛋白质主链原子的 RMSD，包括加载轨迹、设置参考结构和执行 RMSD 计算。
MOE脚本命令简介 - 高级函数(3) - 百度经验
maxconfhits:0, maxmolhits:1, molfield:'mol', o_molfield:'mol', o_mseqfield:'mseq', o_rmsdfield:'rmsd', o_...
全反式构象的均方回转半径怎么算?
全反式构象的均方回转半径（RMSD，Root Mean Square Deviation）通常用于描述分子或化合物的构象的扭曲程度。要计算全反式构象的均方回转半径，可以按照以下步骤进行：定义构象...
怎么用excel求实验值和理论值的均方根偏差rmsd - ZOL问答
要在Excel中计算实验值和理论值的均方根偏差(RMSD),可以按照以下步骤进行操作:1. 在Excel中打开一个表格,将实验值和理论值分别放在不同的列中。2. 使用SUMPRODUCT函数来计算平均值...
新手求助有关RMSD,RMSF等计算
1、我想先跑10~30ns，你可以先跑10ns,计算RMSD看看蛋白的结构变化是不是稳定了，AMBER7 is OK 。2、我想可以先计算骨架的RMSD,RMSF（这些原子是一样的）。另外你突变...
VMD中如何计算两个分子的RMSD值?
导入成同一个分子的两帧，Extensions→Analysis→RMSD Trajectory Tool，选区选要计算RMSD的组，关掉noh(如果你想包括氢)，先用Align做对齐，再...
VMD使用教程
选择“File”菜单中的“Render”，然后选择合适的渲染选项并保存图片以获得高清渲染图像。RMSD计算：VMD提供了内置工具来计算两个分子的RMSD，在Graphics的Representations中即可...
动力学模拟rmsd周期性一直去除不了周期性 - 服务器 - CSDN...
动力学模拟rmsd周期性一直去除不了周期性动力学模拟在linux终端rmsd周期性一直去除不了周期性有没有什么办法啊，一直不稳定JWE233286一种基于机器视觉的水表指针读数识别及修正的方法 专利发明者